Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- m -

• manager : AbstractAligner
• MasaNet() : MasaNet
• masaNet : MasaNetCLI
• MasaNetJob() : MasaNetJob
• MasaNetStatus() : MasaNetStatus
• match : score_params_t , AlignerManager , AlignmentParams
• matchColumn() : AlignerUtils
• matches : Alignment , total_score_t
• matchLastColumn() : AbstractAligner , IAligner
• max_alignments : Job
• max_i : AbstractBlockPruning
• max_iterations : Configs
• max_j : AbstractBlockPruning
• max_partition_size : Configs
• maxFlushDeep : Job
• maximum_seq0_len : aligner_capabilities_t
• maximum_seq1_len : aligner_capabilities_t
• min_score : BestScoreList
• min_step : SpecialRowReader
• minBlockHeight : Grid
• minBlockWidth : Grid
• mismatch : AlignerManager , AlignmentParams , score_params_t
• mismatches : Alignment , total_score_t
• modifiers : SequenceData , Sequence
• msg : IOException
• mustContinue() : AlignerManager , AbstractAligner , IManager
• mustDispatchLastCell() : AlignerManager , AbstractAligner , IManager
• mustDispatchLastColumn() : AlignerManager , AbstractAligner , IManager
• mustDispatchLastRow() : AbstractAligner , IManager , AlignerManager
• mustDispatchScores() : AbstractAligner , AlignerManager , IManager
• mustDispatchSpecialColumns() : IManager , AbstractAligner , AlignerManager
• mustDispatchSpecialRows() : AbstractAligner , AlignerManager , IManager
• mustPruneBlocks() : IManager , AbstractAligner , AlignerManager
• mutex : RecurrentTimer , MasaNet , Buffer2 , AbstractAlignerSafe , BestScoreList , SpecialRowWriter , Peer , Buffer
• myId : MasaNet